Teaching

 Dozierende: Dr. Konstantin Lepikhov, Prof. Dr. Jörn Walter, Prof. Dr. Julia Schulze-Hentrich

Prof. Dr. Jörn Walter

Prof. Dr. Julia Schulze-Hentrich

Dr. Konstantin Lepikhov

Zielgruppe: Studierende des Bachelor Human und Molekularbiologie, Lehramt Biologie, Bioinformatik, Psychologie (NF), Biophysik, .....

Zeit: Dienstags 10:15-11:45 Uhr Mittwochs 8:30-10:00 Uhr
Vorlesungsbeginn: 24.10.2023
Ort: Gebäude B2. 1, Hörsaal 2


Die Vorlesung wird in Präsenz stattfinden und wird online via MS Teams übertragen (Code: j6c6ofp). Soweit technisch geklärt werden die Vorlesungen aufgezeichnet und sind dann über den MS Teams Kanal temporär (ca. 6 Monate) abrufbar. Alle Vorlesungsfolien werden nach der VL hochgeladen und sind über den MS-Teams-Kanal abrufbar. Die Folien sind ausschließlich für den eigenen Lerngebrauch zu nutzen und dürfen nicht weitergegeben werden.

Themen und Termine

Die Tutorien als Vorbereitung zur Klausur werden ausschließlich online von Annemarie und Alea in MS Teams unter dem bekannten link durchgeführt: Termin Dienstag 30.01.2024 um 10:15 Uhr oder Mittwoch 31.01.2024 um 8:30 Uhr (wird noch festgelegt).
Fragen können und sollen vorab per email bis 26.01.2024, 18:00 Uhr an annemarie.jungmann@web.de oder alea.leismann@uni-saarland.de gestellt werden.

Klausur: Die Abschluß-Klausur wird am 14.02.2024 um 8:30 Uhr im Hörsaal B2.1 stattfinden.  Bitte finden Sie sich mindestens 10 min vor Beginn der Klausur vor dem Hörsaal ein.

Die Nachklausur findet Anfang April 2024 im Hörsaal B2.1 statt. Der genaue Termin wird noch bekannt gegeben. Für beide Klausuren ist die Anmeldung im LSF verpflichtend für Biologen, Bioinformatiker und Biophysiker. Studierende der Psychologie, Chemie etc. melden sich direkt bei uns per email an .

Zudem sind die Noten nach abgeschlossener Korrektur im LSF einzusehen.

"Scheine" für nicht im LSF registrierte TeilnehmerInnen (Psychologie, Chemie, etc. ) werden aus organisatorischen Gründen erst ab dem SS ausgestellt und können vormittags im Sekretariat der Genetik entgegengenommen werden .

Die Folien sind passwordgeschützt und dürfen nur von registrierten Studierenden genutzt werden. Die Inhalte bilden die Grundlagen für die Klausur. Dabei sind die Folien nur eine Lern-Hilfe kein Ersatz für die Teilnahme. Zu einigen Vorlesungen sind zudem Fragen zur Selbstarbeit angeführt. Fragen und Inhalte können zudem zur Klausurvorbereitung im Rahmen eines freiwilligen Tutoriums (TerminEnde Januar 2023) mit den TutoriumsleiterInnen diskutiert werden.

Disclaimer: Alle in den Vorlesungen genutzten Abbildungen unterliegen dem Urheberrecht und sind entsprechend gekennzeichnet. Sie sind nur und ausschließlich für das eigene Studium zu nutzen. Eine Weitergabe an Dritte, Kopieren oder anderweitige Nutzung ist nicht gestattet! .


Empfohlene Lehrbücher für die Vorlesung:
Molekulare Genetik , Hrsg.: Alfred Nordheim, Rolf Knippers, 10. Auflage 2015, 568 S. , 620 Abb. , Broschiert ISBN: 9783134770100

Genetik , Hrsg.: Jochen Graw, Springer Verlag, 2015, Kartoniert ISBN 978-3-662-44817-5

Das Mastermodul ADV-I findet gemeinsam mit den AGs Humangenetik/Medizinische Biochemie (Dr. Nicole Ludwig, Prof. Dr. David Mick) und Zell- und Entwicklungsbiologie (Prof. Dr. Sandra Iden) als Präsenzveranstaltung zwischen dem 16.10. und 01.12.2023 statt.

Vorstellung Mastermodul ADV-I: 06.10.2023, 13:00 Uhr, Geb. A4.3, SR

Im 3. Block Epigenetik werden Vorlesungen, Begleitseminare und experimentellen Teile in Präsenz stattfinden.

Praktikumstermine Block Epigenetik: 10.11.(Freitag !!!)-23.11.2023

Vorlesung (auf englisch): täglich 8:30 Uhr - 10.00 Uhr, Geb.A4.3, Seminarraum, nur am 10.11. findet die Vorlesung in Geb. B2.1, HS2, statt.

Folien zur Vorstellung und das Praktikumsskript werden im Team spätestens in der KW44 erhältlich sein.

Praktikum: täglich 10:15 Uhr - ca. 17 Uhr
Begleitseminar: täglich 10.15 Uhr - 11.15 Uhr
Abschlussseminar: 27.11.2023, 9:00 Uhr, Geb.A4.3, SR
Klausur: 01.12.2023, 10:00 Uhr, Geb. 35, HS2 (Hom)
Nachklausur: Anfang April 2024, genauer Termin und Ort werden hier bekannt gegeben
Anmeldung im LSF, die Prüfung(en) sind im LSF freigeschaltet

Praktikumsfiles

werden aufgrund der Größe der Files im Team erhältlich sein.

The lectures provide an overview of epigenetic concepts and their relevance for human biology. Following an introduction into basic mechanisms and enzymology of epigenetic control we will discus the developmental aspects of epigenetic modifications, particularly their importance for cell fate maintenance and cell function. Following a summary of disease related aspects the last four lectures will introduce into epigenomic mapping technologies, the basic principles of epigenetic data production, data management and data interpretation.

Audience: Master Students of bioinformatics (biotechnology, biophysics and pharmacy). Basic knowledge in molecular genetics is essential! The lectures will be held together with the Biology Master Students participating in the ADV-I module. Please register in the University LSF before November, 3th !

Teaching language: English

Format: The lecture will be streamed via MS Teams (code: j6c6ofp). The link to the stream can be obtained from the teams channel.

Lecturers:
Jörn Walter, Julia Schulze-Hentrich, Gilles Gasparoni, Kathrin Kattler, Konstantin Lepikhov

Venue: Bld. A4.3, 8:30 starting Nov, 10th. Please note that on Nov, 10th, the lecture will be given in Bld. B2.1, lecture hall 2 !
Content: Nine lectures (90min each)

Structure and Lecture slides

Exam: Bld. A4.3, seminar room + microscopy room; Jan, 24th 2024, 8:30 - 10:00.
Final registration is required in the University LSF system before January 17th !!!

Re-Exam: early in April 2024, exact date to be determined
Final registration is required in the University LSF system before March 30th !!!

If you are a student of Bioinformatics please register in LSF or in case of technical problems with registration please contact Nadine Wilhelm (nwilhelm@bioinf.uni-sb.de). If you are a student of Biotechnology please write a registration mail to Prof. Walter (j.walter@mx.uni-saarland.de).


A successful passing of this test/examen is obligatory to receive the credit points for this lecture and to participate in the second lecture series in SS 2024 “Computational methods for epigenome analysis” (Lecture + practical course).


Suggested textbooks for Epigenetics:

"Epigenetics", by David Allis, Marie-Laure Caparros, Thomas Jenuwein, Danny Reinberg, Monika Lachlan, 2015, 984 pages, ISBN 978-1-936113-59-0

"Molekulare Genetik" (mit einem Kapitel über Epigenetik), Hrsg.: Alfred Nordheim, Rolf Knippers, 10. Auflage 2015, 568 S. , 620 Abb. , ISBN: 9783134770100 (only available in german)

Additional introductory literature for cancer epigenetics:
"Cancer Genetics and Epigenetics: Two Sides of the Same Coin?" Review by You & Jones dx.doi.org/10.1016/j.ccr.2012.06.00

Das Seminar ist eine Pflichtveranstaltung für Lehramtstudierende, die den Studiengang für die Gymnasiale Oberstufe belegt haben.
Voraussetzung für die Teilnahme ist eine bestandene Klausur zu den Grundlagen der Genetik und eine erfolgreiche Teilnahme am Praktikum Genetik für LehrämterInnen.

Verschiedenste Themen unter dem Oberbegriff Synthetische Biologie wie Stammzellen, Somatische Therapie, SARS-CoV-2, Genomchirurgie in Pflanze und Säugern, oder weiße Gentechnologie werden in Posterpräsentationen behandelt.

Anmeldung bis 11.09.2023 per eimal an s.tierling@mx.uni-saarland.de
Themenvergabe: 22.9.2023, ca. 12:00 Uhr, Geb. A4.3, Seminarraum 0.33
Termin: 14. und 15.12.2023
Ort: Geb. A2.4, EG, Seminarraum 0.33
Leitung: Dr. Kathrin Kattler, Dr. Sascha Tierling

Themen

Interessierte Studierende aller Fachrichtungen sind herzlich willkommen !

Das Biologische Praktikum für BioinformatikerInnen ist eine Veranstaltung für Bachelorstudierende der Bioinformatik, die von mehreren Arbeitsgruppen des ZHMB angeboten wird. Ziel ist, den Studierenden Einblicke in verschiedene Themenfelder der experimentellen Biologie zu geben und ihnen grundlegene Kenntnisse/Fertigkeiten zu vermitteln.

Praktikumszeitraum: 04.03. - 15.03.2024
Anmeldung bis 19.01.2024 per Email an Frau Nadine Wilhelm (nwilhelm@bioinf.uni-sb.de) ! Die TeilnehmerInnenzahl ist auf 14 begrenzt !

Vorbesprechung (oligatorisch !!!): 23. Februar 2024, 14:00 Uhr, MS-Teams, Einladung wird 1-2 Tage vorher verschickt

Praktikumstermine Epigenetik:
Wann ? Versuch 8: 05.03.2024, 9:00 Uhr; Versuch 1: 11.03.+12.03.2024, 9:00 Uhr
Wo ? Theoretische Einführung und praktische Durchführung in Geb.A2.4, Seminarraum 0.33, Praktikumsraum 0.17

Files für die Analyse im BiQ Analyzer HT (V1)

Mitzubringende Ausrüstung:

ausgedrucktes Praktikumsskript
wasserfester Stift zum Beschriften von Reaktionsgefässen
Laborkittel
UV-sichere Schutzbrille (falls vorhanden)
Motivation

Dozierende: Dr. Konstantin Lepikhov, Prof. Dr. Jörn Walter

Prof. Dr. Jörn Walter

Dr. Konstantin Lepikhov

Zielgruppe: Studierende des Bachelor Human und Molekularbiologie, Lehramt Biologie, Bioinformatik, Psychologie (NF), Biophysik, .....

Zeit: Dienstags 10:15-11:45 Uhr Mittwochs 8:30-10:00 Uhr
Vorlesungsbeginn: 25.10.2022
Ort: Gebäude A1 7, großer Hörsaal


Die Vorlesung wird in Präsenz stattfinden und wird online via MS Teams übertragen (Code: 90eow2h). Soweit technisch geklärt werden die Vorlesungen aufgezeichnet und sind/waren dann über den MS Teams Kanal temporär (ca 14 Tage) abrufbar. Alle Vorlesungsfolien werden nach der VL hochgeladen und sind dort und über unsere Homepage abrufbar. Die Folien sind ausschließlich für den eigenen Lerngebrauch zu nutzen und dürfen nicht weitergegeben werden. 

Themen und Termine


Klausur: Die Abschluß-Klausur wird am 15.02.2023 um 8:30 Uhr im Hörsaal A1.7 stattfinden. Bitte finden Sie sich mindestens 15 min vor Beginn der Klausur vor dem Hörsaal ein, wobei Sie Gruppenbildung vermeiden.

Ergebnisse

Die Nachklausur findet am 12.04.2023, 15:00-16:30 Uhr im Hörsaal A1.7 statt. Für beide Klausuren ist die Anmeldung im LSF verpflichtend für Biologen, Bioinformatiker und Biophysiker. Studierende der Psychologie, Chemie etc. melden sich direkt bei uns per email an.

Ergebnisse

Zudem sind die Noten nach abgeschlossener Korrektur im LSF einzusehen.

"Scheine" für nicht im LSF registrierte TeilnehmerInnen (Psychologie, Chemie, etc. ) werden aus organisatorischen Gründen erst ab dem SS ausgestellt und können vormittags im Sekretariat der Genetik entgegengenommen werden .

Die Folien sind passwordgeschützt und dürfen nur von registrierten Studierenden genutzt werden. Die Inhalte bilden die Grundlagen für die Klausur. Dabei sind die Folien nur eine Lern-Hilfe kein Ersatz für die Teilnahme. Zu einigen Vorlesungen sind zudem Fragen zur Selbstarbeit angeführt. Fragen und Inhalte können zudem zur Klausurvorbereitung im Rahmen eines freiwilligen Tutoriums mit den TutoriumsleiterInnen diskutiert werden.

Vorlesungsfolien werden zu gegebener Zeit hier eingestellt.

Disclaimer: Alle in den Vorlesungen genutzten Abbildungen unterliegen dem Urheberrecht und sind entsprechend gekennzeichnet. Sie sind nur und ausschließlich für das eigene Studium zu nutzen. Eine Weitergabe an Dritte, Kopieren oder anderweitige Nutzung ist nicht gestattet! .


Empfohlene Lehrbücher für die Vorlesung:
Molekulare Genetik , Hrsg.: Alfred Nordheim, Rolf Knippers, 10. Auflage 2015, 568 S. , 620 Abb. , Broschiert ISBN: 9783134770100

Genetik , Hrsg.: Jochen Graw, Springer Verlag, 2015, Kartoniert ISBN 978-3-662-44817-5

Das Mastermodul ADV-I findet gemeinsam mit den AGs Humangenetik/Medizinische Biochemie (Dr. Nicole Ludwig, Jun.Prof. Dr. David Mick) und Zell- und Entwicklungsbiologie (Prof. Dr. Sandra Iden) als Teilpräsenzveranstaltung zwischen dem 17.10. und 02.12.2022 statt. MS-Teams-Code: kycwk9v.

Vorstellung Mastermodul ADV-I: 30.09.2022 13:00 Uhr, Geb.A4.3, SR0.01

Folien Vorstellung ADV-I

Im 3. Block Epigenetik werden Vorlesungen, Begleitseminare und experimentellen Teile nach Möglichkeit und im Rahmen des aktuellen Pandemieplans der Universität in Präsenz stattfinden. Wenn Abstände von mind. 1,5m nicht eingehalten werden können (z.B. bei Gruppenarbeit), muß von den TeilnehmerInnen eine Mund-Nasen-Schutzmaske getragen werden.

Praktikumstermine Block Epigenetik: 11.11.(Freitag !!!)-24.11.2022

Vorlesung (auf englisch): täglich 8:30 Uhr - 10.00 Uhr, Geb.A4.3, Seminarraum

Praktikumsskript und Zeitplan

Praktikum: täglich 10:15 Uhr - ca. 17 Uhr
Begleitseminar: täglich 10.15 Uhr - 11.15 Uhr
Abschlussseminar: 28.11.2022, 9:00 Uhr, MS-Teams oder Geb.A4.3
Klausur: 02.12.2022, 13:00 Uhr, Geb.A4.3, Mikroskopierraum
Nachklausur: 04.04.2023, 16:00-17:30 Uhr, Geb.A4.3, Seminarraum
Anmeldung im LSF, die Prüfung(en) sind im LSF freigeschaltet

Vorlesungsfolien

Praktikumsfiles
Region 1
Region 2
Files zum Upload in IGV-Browser

The lectures provide an overview of epigenetic concepts and their relevance for human biology. Following an introduction into basic mechanisms and enzymology of epigenetic control we will discus the developmental aspects of epigenetic modifications, particularly their importance for cell fate maintenance and cell function. Following a summary of disease related aspects the last four lectures will introduce into epigenomic mapping technologies, the basic principles of epigenetic data production, data management and data interpretation.

Audience: Master Students of bioinformatics (biotechnology, biophysics and pharmacy). Basic knowledge in molecular genetics is essential! The lectures will be held together with the Biology Master Students participating in the ADV-I module. Please register in the University LSF before November, 4th !

Teaching language: English

Format: The lecture will be streamed via MS Teams (code: Kycwk9v). The link to the stream can be obtained from the teams channel.

Lecturers:
Jörn Walter, Gilles Gasparoni, Kathrin Kattler, Konstantin Lepikhov

Venue: Bld. A4.3, 8:30 starting Nov, 11th
Content: Nine lectures (90min each)

Structure and lecture slides

Exam: January, 24th 2023, 8:30-10:00, building A4.3, microscopy room
Final registration is required in the University LSF system before December 30th !!!

Results

Re-Exam: April, 5th, 10:00-11:30, building B2.1, lecture hall 2
Final registration is required in the University LSF system before March 11th

Results

If you are a student of Bioinformatics please register in LSF or in case of technical problems with registration please contact Nadine Wilhelm (nwilhelm@bioinf.uni-sb.de). If you are a student of Biotechnology please write a registration mail to Prof. Walter (j.walter@mx.uni-saarland.de).


A successful passing of this test/examen is obligatory to receive the credit points for this lecture and to participate in the second lecture series in SS 2023 “Computational methods for epigenome analysis” (Lecture + practical course).


Suggested textbooks for Epigenetics:

"Epigenetics", by David Allis, Marie-Laure Caparros, Thomas Jenuwein, Danny Reinberg, Monika Lachlan, 2015, 984 pages, ISBN 978-1-936113-59-0

"Molekulare Genetik" (mit einem Kapitel über Epigenetik), Hrsg.: Alfred Nordheim, Rolf Knippers, 10. Auflage 2015, 568 S. , 620 Abb. , ISBN: 9783134770100 (only available in german)

Additional introductory literature for cancer epigenetics:
"Cancer Genetics and Epigenetics: Two Sides of the Same Coin?" Review by You & Jones dx.doi.org/10.1016/j.ccr.2012.06.00

Das Seminar ist eine Pflichtveranstaltung für Lehramtstudierende, die den Studiengang für die Gymnasiale Oberstufe belegt haben.
Voraussetzung für die Teilnahme ist eine bestandene Klausur zu den Grundlagen der Genetik und eine erfolgreiche Teilnahme am Praktikum Genetik für LehrämterInnen.

Verschiedenste Themen unter dem Oberbegriff Synthetische Biologie wie Stammzellen, Somatische Therapie, SARS-CoV-2, Genomchirurgie in Pflanze und Säugern, oder weiße Gentechnologie werden in Posterpräsentationen behandelt.

Anmeldung bis 12.09.2022 per eimal an s.tierling@mx.uni-saarland.de
Themenvergabe: 21.9.2022, 13:00 Uhr, Geb.A4.3, SR0.01
Termin: 16.12.2022, 9:00 Uhr
Ort: Geb. A2.4, EG, Seminarraum 0.33
Leitung: Dr. Kathrin Kattler, Dr. Sascha Tierling

Interessierte Studierende aller Fachrichtungen sind herzlich willkommen !
 

Themenvergabe

Postervorlage und Hinweise für Posterpräsentationen

Bitte mindestens 15 min vor dem Start des Seminars erscheinen und die Poster an die dafür vorgesehenen Stellwände anpinnen. Während der Vorträge im Seminarraum besteht keine Maskenpflicht.

Das Biologische Praktikum für BioinformatikerInnen ist eine Veranstaltung für Bachelorstudierende der Bioinformatik, die von mehreren Arbeitsgruppen des ZHMB angeboten wird. Ziel ist, den Studierenden Einblicke in verschiedene Themenfelder der experimentellen Biologie zu geben und ihnen grundlegene Kenntnisse/Fertigkeiten zu vermitteln.
Die Durchführung des Praktikums ist als Präsenzveranstaltung geplant, jedoch abhängig vom aktuellen Pandemieplan der Universität.

Die praktischen Teile des Praktikums finden vom 06.03.-15.03.2023, die Abschlußvorträge am 17.03.2023 statt. Anmeldung bis 20.01.2023 per Email an Frau Nadine Wilhelm (nwilhelm@bioinf.uni-sb.de) ! Die TeilnehmerInnenzahl kann aufgrund des geltenden Pandemieplans der Universität begrenzt werden !

Vorbesprechung (oligatorisch !!!): 24. Februar 2023, 14:00 Uhr, MS-Teams, Einladung wird 1-2 Tage vorher verschickt

Praktikumstermine Epigenetik:
Wann ? Versuch 8: 07.03.2023, 9:00 Uhr; Versuch 1: 13.03.+14.03.2023, 9:00 Uhr
Wo ? Theoretische Einführung und praktische Durchführung in Geb.A2 4, Seminarraum 0.33, Praktikumsraum 0.17

Organisation

Skripte

Mitzubringende Ausrüstung:

ausgedrucktes Praktikumsskript
wasserfester Stift zum Beschriften von Reaktionsgefässen
Laborkittel
UV-sichere Schutzbrille (falls vorhanden)
Motivation