Methoden, Geräte und aktuelle Projekte

Dem neurogenetischen Labor der Klinik für Psychiatrie & Psychotherapie stehen neben den für molekular- und zellbiologische sowie pharmakogenetische Experimente üblichen Geräten,
einschließlich Zentrifugen, Elektrophorese, Geldokumentation, ELISA und Zellkultur zusätzlich zwei Forschungsgroßgeräte für die gleichzeitige Analyse einer großen Anzahl an Proben zur Verfügung.

Zum Einen eine fluoreszensbasierte BeadArray-Plattform (HiScan, Illumina), welche sich primär für genomweite Genotypisierungen (SNPs) oder Analysen von Copy Number Variationen (CNVs) eignet und
zum Anderen das voll automatisierte MassArray System (MA4, Sequenom/AgenaBioscience), welches hauptsächlich für systematische SNP-basierte Untersuchungen einzelner Gene bzw. kleinerer
genomischer Regionen oder auch für Replikationen einzelner SNPs (meist bis zu 30 SNPs pro Ansatz im Multiplex Verfahren) verwendet werden kann. Des Weiteren lassen sich auf beiden Gerätesystemen Analysen zur DNA-Methylierung und zu pharmakogenetischen Fragestellungen durchführen.

Zwei Pipettierroboter (Tecan FreedomEvo 8-Kanal Hohlnadel; Matrix 96-Kopf Roboter), ein automatisierter Spotter (RS1000 Nanodispenser), vier ABI 384-Well und zwei ABI 96-Well Cycler ergänzen diese Systeme.

Sie haben ein spannendes Forschungsprojekt, welches wir mit unseren Gerätesystemen und know-how als Kooperations-/Kollaborationspartner unterstützen können? 
Dann kontaktieren Sie uns gerne per Mail.

 

Laborausstattung

HiScan - Illumina
Bead-basierte Mikroarray Technologie zur genomweiten Methylierungs- (EPIC Chip) und Genotypisierungsanalyse (OmniExpress)

MA4 + RS1000 Nanodispenser - Agena Bioscience
individuell anpassbare Methylierungs- und Genotypierungsanalysen mittels MALDI-TOF im 96er oder 384er Format

FreedomEvo 100 - Tecan
8-Kanal Festnadel Pipettierroboter

Matrix
96er Einwegspitzen Pipettierroboter

Infinite M200 - Tecan
qualitative und quantitative Nukleinsäurebestimmung, sowie ELISA Messungen

Fusion SL - Vilber Lourmat
Chemilumineszenz und UV Fluoreszenz Detektionssystem zur Visualisierung von Agarose- und Proteingelen, sowie Western Blots

Methoden

molekulargenetische Methoden:

  • Nukleinsäurepräparation aus verschiedenen Zell- und Gewebetypen (DNA und RNA)
  • PCR
  • Genexpressionsanalysen (miRNA und RNA) mittel quantitativer real-time PCR
  • APOE Genotypisierung mittels RFLP
  • genomweite Genotypisierungs- und DNA-Methylierungsanalysen mittels massenspektrometrischer oder BeadChip-basierter Technologie
  • Pharmakogenomik

immunchemische Proteinanalysen:

  • ELISA
  • Western Blot

zellbiologische Methoden:

  • Kultivierung humaner und muriner Zell-Linien
  • Transfektion (siRNA)

 

Projekte