Lehre

Sommersemester 2023

Grundpraktikum Genetik (2.FS)

Das Praktikum findet vom 22.05.-02.06.2023 von 13-18 Uhr als Vollpräsenzveranstaltung (Geb.A4 3 SR und 1.OG) statt.

Anmeldung über LSF bis zum 21.04.2023 !

Die Modalitäten zur Durchführung werden bei der Vorbesprechung am 08.05.2023, 13:00 Uhr (Geb.A4.3, Mikroskopierraum) bekannt gegeben. Die Teilnahme ist für Studierende obligat !

Mitzubringende Ausrüstung:
-------------------------------
- Laborkittel (100% Baumwolle)
- UV-sichere Schutzbrille DIN EN 166, Kennung 2-1.2 oder 3-1.2
- ausgedrucktes und gelesenes Praktikumsskript
- halblogarithmisches Millimeterpapier (1 Seite pro Gruppe, 1 Dekade auf der Y-Achse) - bereits auf MS Teams hochgeladen
- Block, Dauerschreiber, Bleistift
- wasserfester Stift (Fineliner)

Vorbesprechung (obligat !!!) : 08.05.2023, 13:00 Uhr (Geb. A4.3, Mikroskopierraum)

Der Code zur Registrierung in MS Teams lautet: h1wgu4i

Praktikumsskript

Folien zu theoretischen Einführungen werden hier zu gegebender Zeit eingestellt.

Aufbaupraktikum AP-I: Genomik & Diagnostik (4.FS)

Das Praktikum findet gemeinsam mit den Homburger Gruppen Humangenetik/Med. Biochemie (Dr. Nicole Ludwig, Jun.Prof. Dr. David Mick) und Zell- und Entwicklungsbiologie (Prof. Dr. Sandra Iden) vom 19.06.-07.07.2023 9:15-18 Uhr als Teilpräsenzveranstaltung statt (Theoretische Einführungen in MS Teams und praktische Teile in Praktikumsräumen).

Die Modalitäten werden bei der Vorbesprechung am 12.06.2023, 13:00 Uhr, Campus Homburg, Hörsaal Geb.60, bekannt gegeben.

Der Genetik-Teil findet vom 03.07.-07.07.2023 von 8:30-18:00 Uhr statt.
Vorlesung: täglich 8:30-10:00 Uhr, Geb.A4.3, Seminarraum
Besprechung und Diskussion der praktischen Inhalte: 10:15 Uhr-11:15 Uhr, Geb.A4.3, Seminarraum
Praktischer Teil: Geb.A4.3, Praktikumsraum 1.OG, 13:00-18:00 Uhr

Vorbesprechung: 12.06.2023, 13:00 Uhr, Campus Homburg, Hörsaal Geb.60.
Klausur: 14.07.2023, 13:00 Uhr, Campus Homburg, Hörsaal Geb.60.
Nachklausur: zu Beginn des WS2023/24, Geb.60 HS oder Geb.45 HS, Hom

Vorlesungsfolien, Skript und weitere Praktikumsmaterialien werden hier zu gegebener Zeit eingestellt.

Lecture & Practical: Computational methods for epigenome analysis

The lecture and course is designed for advanced Master students in Bioinformatics and will be held together with the department Integrative Cellular Biology & Bioinformatics (Jun. Prof. Dr. Fabian Müller).


When ?
2023, August. Exact dates to be determined.


How ?
Six theoretical lectures (90 minutes each) introducing into the biological and bioinformatic background followed by a four day Hands on workshop.


To whom ?
Master students in Bioinformatics should have a basic knowledge in modern genomics and principles of epigenetics. They should have basic skills for script-based programming using the R language. The course will be limited to 20 (bioinformatics) students. Students who attended the lecture “Principles of Epigenetics” will be given priority. Non-bioinformatics students will be accepted on an individual basis if they can show that the requirements are met.

Please find a description of the course here.

To apply for the course please find all the information at Computational Methods for Epigenome Analysis (SoSe 2023) – Integrative Cellular Biology and Bioinformatics (uni-saarland.de)

Exkursion zu Biotech-Standorten in Berlin

In diesem Sommersemester findet wieder die beliebte Exkursion zu Biotech-Standorten in Berlin für Master-Studierende der Biologie und Biotechnologie statt.

Leitung: Prof. Dr. Jörn Walter, Dr. Sascha Tierling

Termin: 17.-18.08.2023.

Das vorläufige Programm und die Modalitäten zur Anmeldung wurden durch die Studienkoordinatoren der Biologie und Biotechnologie zirkuliert.

Deadline für die unverbindliche aber ernsthafte Interessenbekundung: 12.05.2023

Deadline für die verbindliche Anmeldung: 09.06.2023. 

 

Praktikum Genetik für LehrämterInnen und Studierende des Deutsch-Französischen Studiengangs

Das Genetik-Praktikum für Lehrämter findet vom 11.09.-22.09.2023 statt und wurde gezielt für Lehrämter und Studierende des Deutsch-Französischen Studiengangs in Straßburg konzipiert.
Das Praktikum findet als Vollpräsenzveranstaltung im Geb. A4.3, SR und Praktikumsraum 1.OG statt.

Die Modalitäten zur Durchführung werden bei der Vorbesprechung am 01.09.2023, 13:00 Uhr, Geb.A2.4, SR0.33, bekannt gegeben.

Anmeldung bis zum 11.08.2023:

Lehrämter über LSF
Studenten aus Straßburg bitte email an s.tierling@mx.uni-saarland.de


Vorbesprechung (obligat): 01.09.2023, 13:00 Uhr, Geb.A2.4, SR0.33.

Mitzubringende Ausrüstung:
-------------------------------
- Laborkittel (100% Baumwolle)
- UV-sichere Schutzbrille DIN EN 166
- ausgedrucktes und gelesenes Praktikumsskript
- Block, Dauerschreiber, Bleistift
- wasserfester Stift zum Beschriften von Reaktionsgefäßen (Fineliner)

Praktikumsskript und Folien zu theoretischen Inhalten werden hier zu gegebener Zeit eingestellt.

Wintersemester 2022/23

Vorlesung Grundlagen der Genetik

 Dozierende: Dr. Konstantin Lepikhov, Prof. Dr. Jörn Walter

Prof. Dr. Jörn Walter

Dr. Konstantin Lepikhov

Zielgruppe: Studierende des Bachelor Human und Molekularbiologie, Lehramt Biologie, Bioinformatik, Psychologie (NF), Biophysik, .....

Zeit: Dienstags 10:15-11:45 Uhr Mittwochs 8:30-10:00 Uhr
Vorlesungsbeginn: 25.10.2022
Ort: Gebäude A1 7, großer Hörsaal


Die Vorlesung wird in Präsenz stattfinden und wird online via MS Teams übertragen (Code: 90eow2h). Soweit technisch geklärt werden die Vorlesungen aufgezeichnet und sind/waren dann über den MS Teams Kanal temporär (ca 14 Tage) abrufbar. Alle Vorlesungsfolien werden nach der VL hochgeladen und sind dort und über unsere Homepage abrufbar. Die Folien sind ausschließlich für den eigenen Lerngebrauch zu nutzen und dürfen nicht weitergegeben werden. 

Themen und Termine


Klausur: Die Abschluß-Klausur wird am 15.02.2023 um 8:30 Uhr im Hörsaal A1.7 stattfinden. Bitte finden Sie sich mindestens 15 min vor Beginn der Klausur vor dem Hörsaal ein, wobei Sie Gruppenbildung vermeiden.

Ergebnisse

Die Nachklausur findet am 12.04.2023, 15:00-16:30 Uhr im Hörsaal A1.7 statt. Für beide Klausuren ist die Anmeldung im LSF verpflichtend für Biologen, Bioinformatiker und Biophysiker. Studierende der Psychologie, Chemie etc. melden sich direkt bei uns per email an.

Ergebnisse

Zudem sind die Noten nach abgeschlossener Korrektur im LSF einzusehen.

"Scheine" für nicht im LSF registrierte TeilnehmerInnen (Psychologie, Chemie, etc. ) werden aus organisatorischen Gründen erst ab dem SS ausgestellt und können vormittags im Sekretariat der Genetik entgegengenommen werden .

Die Folien sind passwordgeschützt und dürfen nur von registrierten Studierenden genutzt werden. Die Inhalte bilden die Grundlagen für die Klausur. Dabei sind die Folien nur eine Lern-Hilfe kein Ersatz für die Teilnahme. Zu einigen Vorlesungen sind zudem Fragen zur Selbstarbeit angeführt. Fragen und Inhalte können zudem zur Klausurvorbereitung im Rahmen eines freiwilligen Tutoriums mit den TutoriumsleiterInnen diskutiert werden.

Vorlesungsfolien werden zu gegebener Zeit hier eingestellt.

Disclaimer: Alle in den Vorlesungen genutzten Abbildungen unterliegen dem Urheberrecht und sind entsprechend gekennzeichnet. Sie sind nur und ausschließlich für das eigene Studium zu nutzen. Eine Weitergabe an Dritte, Kopieren oder anderweitige Nutzung ist nicht gestattet! .


Empfohlene Lehrbücher für die Vorlesung:
Molekulare Genetik , Hrsg.: Alfred Nordheim, Rolf Knippers, 10. Auflage 2015, 568 S. , 620 Abb. , Broschiert ISBN: 9783134770100

Genetik , Hrsg.: Jochen Graw, Springer Verlag, 2015, Kartoniert ISBN 978-3-662-44817-5

Mastermodul ADV-I (Epigenetik)

Das Mastermodul ADV-I findet gemeinsam mit den AGs Humangenetik/Medizinische Biochemie (Dr. Nicole Ludwig, Jun.Prof. Dr. David Mick) und Zell- und Entwicklungsbiologie (Prof. Dr. Sandra Iden) als Teilpräsenzveranstaltung zwischen dem 17.10. und 02.12.2022 statt. MS-Teams-Code: kycwk9v.

Vorstellung Mastermodul ADV-I: 30.09.2022 13:00 Uhr, Geb.A4.3, SR0.01

Folien Vorstellung ADV-I

Im 3. Block Epigenetik werden Vorlesungen, Begleitseminare und experimentellen Teile nach Möglichkeit und im Rahmen des aktuellen Pandemieplans der Universität in Präsenz stattfinden. Wenn Abstände von mind. 1,5m nicht eingehalten werden können (z.B. bei Gruppenarbeit), muß von den TeilnehmerInnen eine Mund-Nasen-Schutzmaske getragen werden.

Praktikumstermine Block Epigenetik: 11.11.(Freitag !!!)-24.11.2022

Vorlesung (auf englisch): täglich 8:30 Uhr - 10.00 Uhr, Geb.A4.3, Seminarraum

Praktikumsskript und Zeitplan

Praktikum: täglich 10:15 Uhr - ca. 17 Uhr
Begleitseminar: täglich 10.15 Uhr - 11.15 Uhr
Abschlussseminar: 28.11.2022, 9:00 Uhr, MS-Teams oder Geb.A4.3
Klausur: 02.12.2022, 13:00 Uhr, Geb.A4.3, Mikroskopierraum
Nachklausur: 04.04.2023, 16:00-17:30 Uhr, Geb.A4.3, Seminarraum
Anmeldung im LSF, die Prüfung(en) sind im LSF freigeschaltet

Vorlesungsfolien

Praktikumsfiles
Region 1
Region 2
Files zum Upload in IGV-Browser

Lecture: Principles of Epigenetics and Genomics

The lectures provide an overview of epigenetic concepts and their relevance for human biology. Following an introduction into basic mechanisms and enzymology of epigenetic control we will discus the developmental aspects of epigenetic modifications, particularly their importance for cell fate maintenance and cell function. Following a summary of disease related aspects the last four lectures will introduce into epigenomic mapping technologies, the basic principles of epigenetic data production, data management and data interpretation.

Audience: Master Students of bioinformatics (biotechnology, biophysics and pharmacy). Basic knowledge in molecular genetics is essential! The lectures will be held together with the Biology Master Students participating in the ADV-I module. Please register in the University LSF before November, 4th !

Teaching language: English

Format: The lecture will be streamed via MS Teams (code:
Kycwk9v). The link to the stream can be obtained from the teams channel.

Lecturers:
Jörn Walter, Gilles Gasparoni, Kathrin Kattler, Konstantin Lepikhov

Venue: Bld. A4.3, 8:30 starting Nov, 11th
Content: Nine lectures (90min each)

Structure and lecture slides

Exam: January, 24th 2023, 8:30-10:00, building A4.3, microscopy room
Final registration is required in the University LSF system before December 30th !!!

Results

Re-Exam: April, 5th, 10:00-11:30, building B2.1, lecture hall 2
Final registration is required in the University LSF system before March 11th !!

Results

If you are a student of Bioinformatics please register in LSF or in case of technical problems with registration please contact Nadine Wilhelm (nwilhelm@bioinf.uni-sb.de). If you are a student of Biotechnology please write a registration mail to Prof. Walter (j.walter@mx.uni-saarland.de).


A successful passing of this test/examen is obligatory to receive the credit points for this lecture and to participate in the second lecture series in SS 2023 “Computational methods for epigenome analysis” (Lecture + practical course).


Suggested textbooks for Epigenetics:


"Epigenetics", by David Allis, Marie-Laure Caparros, Thomas Jenuwein, Danny Reinberg, Monika Lachlan, 2015, 984 pages, ISBN 978-1-936113-59-0

"Molekulare Genetik" (mit einem Kapitel über Epigenetik), Hrsg.: Alfred Nordheim, Rolf Knippers, 10. Auflage 2015, 568 S. , 620 Abb. , ISBN: 9783134770100 (only available in german)

Additional introductory literature for cancer epigenetics:

"Cancer Genetics and Epigenetics: Two Sides of the Same Coin?" Review by You & Jones dx.doi.org/10.1016/j.ccr.2012.06.00

Seminar Bio-Gentechnologie (LA)

Das Seminar ist eine Pflichtveranstaltung für Lehramtstudierende, die den Studiengang für die Gymnasiale Oberstufe belegt haben.
Voraussetzung für die Teilnahme ist eine bestandene Klausur zu den Grundlagen der Genetik und eine erfolgreiche Teilnahme am Praktikum Genetik für LehrämterInnen.

Verschiedenste Themen unter dem Oberbegriff Synthetische Biologie wie Stammzellen, Somatische Therapie, SARS-CoV-2, Genomchirurgie in Pflanze und Säugern, oder weiße Gentechnologie werden in Posterpräsentationen behandelt.

Anmeldung bis 12.09.2022 per eimal an s.tierling@mx.uni-saarland.de
Themenvergabe: 21.9.2022, 13:00 Uhr, Geb.A4.3, SR0.01

Termin: 16.12.2022, 9:00 Uhr
Ort: Geb. A2.4, EG, Seminarraum 0.33
Leitung: Dr. Kathrin Kattler, Dr. Sascha Tierling

Interessierte Studierende aller Fachrichtungen sind herzlich willkommen !
 

Themenvergabe

Postervorlage und Hinweise für Posterpräsentationen


Bitte mindestens 15 min vor dem Start des Seminars erscheinen und die Poster an die dafür vorgesehenen Stellwände anpinnen. Während der Vorträge im Seminarraum besteht keine Maskenpflicht.

Praktikum Biowissenschaften für BioinformatikerInnen (B.Sc.)

Das Biologische Praktikum für BioinformatikerInnen ist eine Veranstaltung für Bachelorstudierende der Bioinformatik, die von mehreren Arbeitsgruppen des ZHMB angeboten wird. Ziel ist, den Studierenden Einblicke in verschiedene Themenfelder der experimentellen Biologie zu geben und ihnen grundlegene Kenntnisse/Fertigkeiten zu vermitteln.
Die Durchführung des Praktikums ist als Präsenzveranstaltung geplant, jedoch abhängig vom aktuellen Pandemieplan der Universität.

Die praktischen Teile des Praktikums finden vom 06.03.-15.03.2023, die Abschlußvorträge am 17.03.2023 statt. Anmeldung bis 20.01.2023 per Email an Frau Nadine Wilhelm (nwilhelm@bioinf.uni-sb.de) ! Die TeilnehmerInnenzahl kann aufgrund des geltenden Pandemieplans der Universität begrenzt werden !

Vorbesprechung (oligatorisch !!!): 24. Februar 2023, 14:00 Uhr, MS-Teams, Einladung wird 1-2 Tage vorher verschickt

Praktikumstermine Epigenetik:
Wann ? Versuch 8: 07.03.2023, 9:00 Uhr; Versuch 1: 13.03.+14.03.2023, 9:00 Uhr
Wo ? Theoretische Einführung und praktische Durchführung in Geb.A2 4, Seminarraum 0.33, Praktikumsraum 0.17

Organisation

Skripte

Mitzubringende Ausrüstung:

ausgedrucktes Praktikumsskript
wasserfester Stift zum Beschriften von Reaktionsgefässen
Laborkittel
UV-sichere Schutzbrille (falls vorhanden)
Motivation

Sommersemester 2022

Aufbaupraktikum AP-I: Genomik & Diagnostik (4.FS)

Das Praktikum findet gemeinsam mit den Homburger Gruppen Humangenetik (Dr. Nicole Ludwig) und Zell- und Entwicklungsbiologie (Prof. Dr. Sandra Iden) vom 20.06.-08.07.2022 9-18 Uhr in Teil-bzw. Vollpräsenz an den Standorten UKS und Saarbrücker Campus statt.

Die Modalitäten werden bei der Vorbesprechung am 13.06.2022, 13:00 Uhr (Campus Hom, Geb. 60, HS) bekannt gegeben. Die Teilnahme ist für Studierende, die aktiv am praktischen Teil teilnehmen wollen, obligat !

Der Genetik-Teil findet vom 04.07.-08.07.2022 von 8:15-18:00 Uhr statt.
Vorlesung: täglich 8:15-9:45 Uhr, Geb. A4.3, Seminarraum
Besprechung und Diskussion der praktischen Inhalte: 10:00 Uhr-11:00 Uhr, Geb. A4.3, Seminarraum
Praktischer Teil: Geb. A4.3, Praktikumsraum 1.OG, 12:00-17:00 Uhr

Vorbesprechung: 13.06.2022, 13:00 Uhr (Hom, Geb.60, HS)
Klausur: 18.07.2022, 13:00 Uhr, Hörsaal Geb. 45 (Biochemie), Hom
Nachklausur: 27.09.2022, 10:00 Uhr, Hörsaal,Geb.60, Hom

Skript und Zeitplan

Vorlesungsfolien

Bilder Gelelektrophoresen

FinchTV Installer

Sanger-Sequenzen

Sanger-Sequenzen_Backups​​​​​​​

Grundpraktikum Genetik (2.FS)

Das Praktikum findet vom 11.07.-22.07.2022 von 13-18 Uhr als Vollpräsenzveranstaltung (Geb.A4 3 SR und 1.OG) statt.

Die Modalitäten zur Durchführung werden bei der Vorbesprechung am 20.06.2022, 12:00 Uhr (Geb.A4.3, Mikroskopierraum) bekannt gegeben. Die Teilnahme ist für Studierende obligat !

Mitzubringende Ausrüstung:
-------------------------------
- Laborkittel (100% Baumwolle)
- Mund-/Nasenschutz
- UV-sichere Schutzbrille DIN EN 166, Kennung 2-1.2 oder 3-1.2
- ausgedrucktes und gelesenes Praktikumsskript
- halblogarithmisches Millimeterpapier (1 Seite pro Gruppe, 1 Dekade auf der Y-Achse) - bereits auf MS Teams hochgeladen
- Block, Dauerschreiber, Bleistift
- wasserfester Stift (Fineliner)

Vorbesprechung (obligat !!!) : 20.06.2022, 12:00 Uhr (Geb. A4.3, Mikroskopierraum)

Der Code zur Registrierung in MS Teams lautet: 13cyr3a

Skript und Zeitplan

Praktikum Genetik für LehrämterInnen und Studierende des Deutsch-Französischen Studiengangs

Das Genetik-Praktikum für Lehrämter findet vom 12.09.-23.09.2022 statt und wurde gezielt für Lehrämter und Studierende des Deutsch-Französischen Studiengangs in Straßburg konzipiert.
Nach aktuell gültigem Pandemieplan der Universität findet das Praktikum als Vollpräsenzveranstaltung im Geb. A4.3 SR0.01 und in den Praktikumsräumen im 1.OG statt.

Die Modalitäten zur Durchführung werden bei der Vorbesprechung am 02.09.2022, 11:00 Uhr (Geb.A2.4, SR0.33) bekannt gegeben.

Anmeldung bis zum 12.08.2022:

Lehrämter über LSF
Studenten aus Straßburg bitte email an s.tierling@mx.uni-saarland.de


Vorbesprechung (obligat): 02.09.2022, 11:00 Uhr, Geb. A2.4, SR0.33.

Mitzubringende Ausrüstung:
-------------------------------
- Laborkittel (100% Baumwolle)
- UV-sichere Schutzbrille DIN EN 166
- ausgedrucktes und gelesenes Praktikumsskript
- Block, Dauerschreiber, Bleistift
- wasserfester Stift zum Beschriften von Reaktionsgefäßen(Fineliner)

Praktikumsskript

Registrierung in MS-Teams, Code: ng9m7nq

Lecture & Practical: Computational methods for epigenome analysis

The lecture and course is designed for advanced Master students in Bioinformatics and will be held together with the department Integrative Cellular Biology & Bioinformatics (Jun. Prof. Dr. Fabian Müller).


When ?
2022, August 1st to 15th.


How ?
Six theoretical lectures (90 minutes each) introducing into the biological and bioinformatic background followed by a four day Hands on workshop.


To whom ?
Master students in Bioinformatics should have a basic knowledge in modern genomics and principles of epigenetics. They should have basic skills for script-based programming using the R language. The course will be limited to 20 (bioinformatics) students. Students who attended the lecture “Principles of Epigenetics” will be given priority. Non-bioinformatics students will be accepted on an individual basis if they can show that the requirements are met.

Please find a description of the course here.

To apply for the course please find all the information at Computational Methods for Epigenome Analysis (SoSe 2022) – Integrative Cellular Biology and Bioinformatics (uni-saarland.de)

Exkursion zu Biotech-Standorten in Berlin

In diesem Sommersemester findet nach (Pandemie-bedingt) 3 Jahren wieder die beliebte Exkursion zu Biotech-Standorten in Berlin für Master-Studierende der Biologie statt.

Termin: 11. und 12. August 2022

Leitung: Prof. Dr. Jörn Walter, Dr. Sascha Tierling

Anmeldung bis zum 20.06.2022 auf MS-Teams, Spread Sheet im Allgemeinen Kanal, Code: vqs1te4

Programm

Wintersemester 2021/22

Vorlesung Grundlagen der Genetik

 Dozierende: Dr. Konstantin Lepikhov, Prof. Dr. Jörn Walter

Prof. Dr. Jörn Walter

Dr. Konstantin Lepikhov

Zielgruppe: Studierende des Bachelor Human und Molekularbiologie, Lehramt Biologie, Bioinformatik, Psychologie (NF), Biophysik, .....

Zeit: Dienstags 10:15-11:45 Uhr Mittwochs 8:30-10:00 Uhr
Vorlesungsbeginn: 19.10.2021
Ort: Gebäude A1 7, großer Hörsaal


Die Vorlesung wird in Präsenz stattfinden und wird online via MS Teams übertragen (Code: 78nht2y). Soweit technisch geklärt werden die Vorlesungen aufgezeichnet und sind/waren dann über den MS Teams Kanal temporär (ca 14 Tage) abrufbar. Alle Vorlesungsfolien werden nach der VL hochgeladen und sind dort über unsere Homepage abrufbar. Die Folien sind ausschließlich für den eigenen Lerngebrauch zu nutzen und dürfen nicht weitergegeben werden. Die Themen und Termine zur Vorlesung werden zum ersten Termin bekannt gegeben.


Die Tutorien als Vorbereitung zur Klausur werden ausschließlich online von Annemarie und Judith in MS Teams unter dem bekannten link durchgeführt: Erster Termin Dienstag 01.02.2022 um 10:15 Uhr. Der zweite Termin am Mittwoch 02.02. wird noch zeitlich festgelegt.
Fragen können und sollen vorab per email bis 31.01.2022, 18:00 Uhr an annemarie.jungmann@web.de oder j.gottfreund@gmail.com gestellt werden.

Klausur: Die Abschluß-Klausur wird am 08.02.2022 um 10:15 Uhr im Hörsaal A1.7 stattfinden. Voraussetzung für die Teilnahme ist der Nachweis von 3G (geimpft, getestet oder genesen), der von den Dozenten vor Beginn der Prüfung kontrolliert wird. Bitte finden Sie sich also mindestens 20 min vor Beginn der Klausur vor dem Hörsaal ein, wobei Sie Gruppenbildung vermeiden. Es herrscht während der Prüfung die Pflicht zum Tragen einer medizinischen Mund-Nasenbedeckung (OP-Maske oder FFP2-Maske).

Die Nachklausur findet am 05.04.2022 um 10:15 im Hörsaal A1.7 statt. Für beide Klausuren ist die Anmeldung im LSF verpflichtend für Biologen, Bioinformatiker und Biophysiker. Studierende der Psychologie, Chemie etc. melden sich direkt bei uns per email an .

ERGEBNISSE der Klausur vom 08.02.2022

ERGEBNISSE der Nachklausur vom 05.04.2022


Zudem sind die Noten nach abgeschlossener Korrektur im LSF einzusehen.

"Scheine" für nicht im LSF registrierte TeilnehmerInnen (Psychologie, Chemie, etc. ) werden aus organisatorischen Gründen erst ab dem SS ausgestellt und können vormittags im Sekretariat der Genetik entgegengenommen werden .

Die Folien sind passwordgeschützt und dürfen nur von registrierten Studierenden genutzt werden. Die Inhalte bilden die Grundlagen für die Klausur. Dabei sind die Folien nur eine Lern-Hilfe kein Ersatz für die Teilnahme. Zu einigen Vorlesungen sind zudem Fragen zur Selbstarbeit angeführt. Fragen und Inhalte können zudem zur Klausurvorbereitung im Rahmen eines freiwilligen Tutoriums (TerminEnde Januar 2022 - wird noch vereinbart) mit den TutoriumsleiterInnen diskutiert werden.

 

Vorlesungsfolien

 

Vorlesung_1Vorlesung_2Vorlesung_3Vorlesung_4Vorlesung_5Vorlesung_6Vorlesung_7Vorlesung_8Vorlesung_9Vorlesung_10_11Vorlesung_12Vorlesung_13Vorlesung_14Vorlesung_15Vorlesung 16Vorlesung_17Vorlesung_18Vorlesung_19Vorlesung_20Vorlesung_21Vorlesung_22aVorlesung_23Vorlesung_24

 

Disclaimer: Alle in den Vorlesungen genutzten Abbildungen unterliegen dem Urheberrecht und sind entsprechend gekennzeichnet. Sie sind nur und ausschließlich für das eigene Studium zu nutzen. Eine Weitergabe an Dritte, Kopieren oder anderweitige Nutzung ist nicht gestattet! .


Empfohlene Lehrbücher für die Vorlesung:
Molekulare Genetik , Hrsg.: Alfred Nordheim, Rolf Knippers, 10. Auflage 2015, 568 S. , 620 Abb. , Broschiert ISBN: 9783134770100

Genetik , Hrsg.: Jochen Graw, Springer Verlag, 2015, Kartoniert ISBN 978-3-662-44817-5

Mastermodul ADV-I (Epigenetik)

Das Mastermodul ADV-I findet gemeinsam mit den AGs Humangenetik/Medizinische Biochemie (Dr. Nicole Ludwig, Jun.Prof. Dr. David Mick) und Zell- und Entwicklungsbiologie (Prof. Dr. Sandra Iden) als Teilpräsenzveranstaltung zwischen dem 18.10. und 03.12.2021 statt.

Vorstellung Mastermodul ADV-I: 11.10.2021 12:00 Uhr, Campus Homburg, Geb.45, HS

Im 3. Block Epigenetik werden Vorlesungen, Begleitseminare und experimentellen Teile in Präsenz stattfinden. Es gelten die 3G-Regelungen der Universität mit Registrierung über die Staysio-App. Wenn Abstände von mind. 1,5m nicht eingehalten werden können (z.B. bei Gruppenarbeit), muß von den TeilnehmerInnen eine Mund-Nasen-Schutzmaske getragen werden.

Praktikumstermine Block Epigenetik: 12.11.(Freitag !!!)-25.11.2021

Vorlesung (auf englisch): täglich 8:30 Uhr - 10.00 Uhr, Geb.A4.3, Seminarraum

 

Vorstellung und Praktikumsskript

 

Praktikum: täglich 10:15 Uhr - ca. 17 Uhr
Begleitseminar: täglich 10.15 Uhr - 11.15 Uhr
Abschlussseminar: 29.11.2021, 9:00 Uhr, MS-Teams oder Geb.A4.3
Klausur: 03.12.2021, 12:00 Uhr, Hörsaal, Geb. A1.7 HS
Nachklausur: 05.04.2022, 11:00 Uhr, Geb. A4.3, Seminarraum
Anmeldung im LSF, die Prüfung(en) sind im LSF freigeschaltet

 

Vorlesung

 

Übersicht und StrukturVorlesung_121121Vorlesung_151121+161121Vorlesung_171121Vorlesung_181121Vorlesung_221121
Vorlesung_231121Vorlesung_241121Vorlesung_251121

 

 

Praktikumsfiles

Excel-Dateien zur Wahl differentiell methylierter CpG-Stellen (Region 1)

Excel-Dateien zur Wahl differentiell methylierter CpG-Stellen (Region 2)

BED-Dateien zum Upload im IGV-Browser

Primerdesign

Gelbilder RT-PCR

Gelbilder Bis-PCR

Ergebnisse Bisulfit-Sequenzierung

Backup-Sequenzen Region1

Lecture: Principles of Epigenetics and Genomics

The lectures provide an overview of epigenetic concepts and their relevance for human biology. Following an introduction into basic mechanisms and enzymology of epigenetic control we will discus the developmental aspects of epigenetic modifications, particularly their importance for cell fate maintenance and cell function. Following a summary of disease related aspects the last four lectures will introduce into epigenomic mapping technologies, the basic principles of epigenetic data production, data management and data interpretation.

Audience: Master Students of bioinformatics (biotechnology, biophysics and pharmacy). Basic knowledge in molecular genetics is essential! The lectures will be held together with the Biology Master Students participating in the ADV-I module. Please register in the University LSF before November, 5th !

Teaching language: English

Format: The lecture will be streamed via MS Teams (code: vqs1te4). The link to the stream can be obtained from the teams channel.

Lecturers:
Jörn Walter, Gilles Gasparoni, Kathrin Kattler, Konstantin Lepikhov

Venue: Bld. A4.3, 8:30 starting Nov, 12th
Content: Nine lectures (90min each)

Structure and Lecture slides

 

Structure and ContentLecture_121121Lecture_151121+161121Lecture_171121Lecture_181121Lecture_221121Lecture_231121Lecture_241121Lecture_251121

 

Exam: January 11th 2022 at 8:30 - 10:00am, buildg. B2.1, lecture hall.
Final registration is required in the University LSF system before December 17th !!!

Results


Re-Exam: April, 6th 2022 at 10:00 - 11:30am, buildg. B2.1, lecture hall
Final registration is required in the University LSF system before March 12th !!!

Results

If you are a student of Bioinformatics please register in LSF or in case of technical problems with registration please contact Karin Jostock (jostock@bioinf.uni-sb.de). If you are a student of Biotechnology please write a registration mail to Prof. Walter (j.walter@mx.uni-saarland.de).


A successful passing of this test/examen is obligatory to receive the credit points for this lecture and to participate in the second lecture series in SS 2022 “
Computational methods for epigenome analysis” (Lecture + practical course).


Suggested textbooks for Epigenetics:


"Epigenetics", by David Allis, Marie-Laure Caparros, Thomas Jenuwein, Danny Reinberg, Monika Lachlan, 2015, 984 pages, ISBN 978-1-936113-59-0

"Molekulare Genetik" (mit einem Kapitel über Epigenetik), Hrsg.: Alfred Nordheim, Rolf Knippers, 10. Auflage 2015, 568 S. , 620 Abb. , ISBN: 9783134770100 (only available in german)

Additional introductory literature for cancer epigenetics:

"Cancer Genetics and Epigenetics: Two Sides of the Same Coin?" Review by You & Jones dx.doi.org/10.1016/j.ccr.2012.06.00

Seminar Bio-Gentechnologie (LA)

Das Seminar ist eine Pflichtveranstaltung für Lehramtstudierende, die den Studiengang für die Gymnasiale Oberstufe belegt haben.
Voraussetzung für die Teilnahme ist eine bestandene Klausur zu den Grundlagen der Genetik und eine erfolgreiche Teilnahme am Praktikum Genetik für LehrämterInnen.

Verschiedenste Themen unter dem Oberbegriff Synthetische Biologie wie Stammzellen, Somatische Therapie, SARS-CoV-2, Genomchirurgie in Pflanze und Säugern, oder weiße Gentechnologie werden in Posterpräsentationen behandelt.

Anmeldung bis 13.09.2021 per eimal an s.tierling@mx.uni-saarland.de
Themenvergabe: 22.9.2021, 10:00 Uhr, MS-Teams

Termin: 10.12.2021, 9:00 Uhr, Geb.A2.4, Seminarraum 0.33
Ort: Geb. A2.4, EG, Seminarraum 0.33
Leitung: Dr. Kathrin Kattler, Dr. Sascha Tierling

Themenvergabe und Postervorlage

Interessierte Studierende aller Fachrichtungen sind herzlich willkommen !


Bitte mindestens 15 min vor dem Start des Seminars erscheinen und beim Rein- und Rausgehen in/aus dem Seminarraum/Gebäude Distanz wahren (mind. 1,5m). Die Bestuhlung im Seminarraum ist auf die max. TeilnehmerInnen-Zahl begrenzt. Mund-und Nasenschutz müssen beim Rein- und Rausgehen in/aus dem Seminarraum bzw. bei Toilettengängen getragen werden. Während der Vorträge im Seminarraum besteht keine Maskenpflicht.

Praktikum Biowissenschaften für BioinformatikerInnen (B.Sc.)

Das Biologische Praktikum für BioinformatikerInnen ist eine Veranstaltung für Bachelorstudierende der Bioinformatik, die von mehreren Arbeitsgruppen des ZHMB angeboten wird. Ziel ist, den Studierenden Einblicke in verschiedene Themenfelder der experimentellen Biologie zu geben und ihnen grundlegene Kenntnisse/Fertigkeiten zu vermitteln.
Die Durchführung des Praktikums ist als Präsenzveranstaltung geplant, jedoch abhängig vom aktuellen Pandemieplan der Universität.

Anmeldung bis 21.01.2022 per Email an Frau Nadine Wilhelm (nwilhelm@bioinf.uni-sb.de) ! Die TeilnehmerInnenzahl ist auf 12 begrenzt !

Vorbesprechung (oligatorisch !!!): 25. Februar 2022, 14:00 Uhr, MS-Teams, Einladung wird 1-2 Tage vorher verschickt

Organisation

Praktikumstermine Epigenetik:
Wann ? Versuch 8: 10.03.2022, 9:00 Uhr; Versuch 1: 14.03.+15.03.2022, 9:00 Uhr
Wo ? Theoretische Einführung und praktische Durchführung in Geb.A4 3, Seminarraum (EG), Praktikumsraum (OG)

Praktikumsskripte
 

Files für die Analyse im BiQ Analyzer HT (V1)

Mitzubringende Ausrüstung:

ausgedrucktes Praktikumsskript
wasserfester Stift zum Beschriften von Reaktionsgefässen
Laborkittel
UV-sichere Schutzbrille (falls vorhanden)
Motivation